在PyCharm中连接MySQL数据库，可以通过以下步骤进行：

1、安装必要的库

你需要安装pymysql和ipython库，你可以在PyCharm的终端中使用pip来安装这两个库。

pip install pymysql
pip install ipython

2、导入必要的库

在你的Python文件中，你需要导入以下库：

import pymysql
import getpass

3、创建数据库连接

你可以创建一个连接到你的MySQL数据库的函数，在这个函数中，你需要提供你的数据库的主机名、用户名、密码和数据库名。

def create_conn():
    host = 'localhost'     # 数据库主机名
    user = 'root'          # 数据库用户名
    password = getpass.getpass('Password:')    # 数据库密码
    database = 'test'      # 数据库名
    conn = pymysql.connect(host=host, user=user, password=password, database=database)
    return conn

4、使用连接

现在你可以使用这个连接来执行SQL查询，你可以创建一个函数来获取所有的表名：

def get_tables(conn):
    cursor = conn.cursor()
    cursor.execute("SHOW TABLES")
    tables = cursor.fetchall()
    return [table[0] for table in tables]

5、关闭连接

当你完成所有的查询后，你需要关闭数据库连接：

def close_conn(conn):
    conn.close()

6、运行代码

现在你可以运行你的代码来测试你的连接：

conn = create_conn()
print(get_tables(conn))
close_conn(conn)

注意：以上代码需要在PyCharm的Python环境中运行，而不是在Jupyter Notebook中，如果你想在Jupyter Notebook中使用，你需要稍微修改一下代码。

下面是一个简单的介绍，描述了在 PyCharm 中手动连接 MySQL 数据库和 Jupyter Notebook 的步骤：

请注意，在 PyCharm 中连接 MySQL 数据库通常需要安装额外的数据库插件，而连接 Jupyter Notebook 则可能需要安装并配置 Python 的数据科学包和相应的内核，上述步骤是一个大致的指南，具体操作可能因 PyCharm 版本和配置的不同而有所差异。