MySQL和MariaDB在很多方面都是兼容的，但是也存在一些不同之处，以下是一些主要的差异：

1、存储引擎：MySQL默认的存储引擎是InnoDB，而MariaDB默认的存储引擎是Aria，虽然两者都支持InnoDB和MyISAM，但是MariaDB还提供了一些其他的存储引擎，如TokuDB和RocksDB。

2、性能优化：MariaDB在性能优化方面做了一些改进，例如更好的缓存管理和更高效的查询执行。

3、扩展功能：MariaDB提供一些MySQL不具备的功能，如动态列、窗口函数和多值索引。

4、社区支持：MySQL由Oracle公司维护，而MariaDB由MariaDB基金会维护，两者都有活跃的社区，但是MariaDB的社区更倾向于开源和自由软件的理念。

5、兼容性：虽然MariaDB是MySQL的一个分支，但是在高版本中可能会引入一些不兼容的特性，如果你的应用使用了MySQL的特定特性，可能需要进行一些修改才能在MariaDB上运行。

6、版本更新：MySQL的更新通常比MariaDB更快，因为Oracle有更多的资源来开发和维护它，这也意味着MySQL的版本更新可能包含更多的重大更改，可能需要更多的测试和调整。

如果你的应用已经在MySQL上运行得很好，那么迁移到MariaDB可能需要一些工作，如果你正在寻找一个更开放、更灵活的数据库系统，那么MariaDB可能是一个不错的选择。