Apache下禁止指定目录运行PHP脚本，可以通过以下步骤实现：

1、打开Apache的配置文件httpd.conf，该文件通常位于Apache安装目录下的conf子目录中。

2、在httpd.conf文件中，找到<Directory>标签，该标签用于定义特定目录的配置。

3、在<Directory>标签内部，添加一行配置指令：

“`

<FilesMatch ".php$">

Require all denied

</FilesMatch>

“`

上述配置表示禁止在该目录下执行所有以.php结尾的文件。

4、保存并关闭httpd.conf文件。

5、重启Apache服务器，使配置生效。

通过以上步骤，您可以在Apache中禁止指定目录运行PHP脚本，请确保在进行任何更改之前备份原始配置文件，以防意外情况发生。